Muestreo de fluidos en granjas: ¿Es el pooling de tejidos la nueva frontera para la vigilancia del PRRSV?

Un exhaustivo estudio liderado por Osemeke y colaboradores, publicado recientemente en la revista Porcine Health Management (https://doi.org/10.1186/s40813-025-00432-x), pone sobre la mesa una metodología avanzada para optimizar la detección de patógenos clave como el virus de la Influenza A (IAV) y el Síndrome Reproductivo y Respiratorio Porcino (PRRSV). La investigación se sumerge en la comparación de dos tipos de muestras que hoy dominan la escena diagnóstica: los fluidos de lengua (TF) obtenidos de animales muertos y los fluidos orales (OF). El equipo utilizó modelos de clase latente para evaluar el rendimiento de estas pruebas, partiendo de la base de que ninguna de las dos técnicas puede considerarse por sí sola un "estándar de oro" absoluto.

A través de un sofisticado análisis estadístico que incluyó cadenas de Markov Monte Carlo (MCMC), el estudio determinó que la probabilidad de infección y la prevalencia varían significativamente entre granjas. Uno de los puntos más críticos para los profesionales del sector es la capacidad de estos fluidos para permitir la secuenciación del gen ORF-5 del PRRSV. Los investigadores emplearon modelos de regresión de efectos mixtos para caracterizar las diferencias en el éxito de la secuenciación de Sanger, utilizando los valores de Ct y el tipo de muestra como efectos fijos. Este hallazgo es vital para quienes necesitan no solo saber si el virus está presente, sino conocer su linaje genético para tomar decisiones de manejo.

Para el productor que busca eficiencia, el estudio arroja luz sobre el impacto de diluir las muestras. Mediante un modelo predictivo, se estableció cómo los valores de Ct aumentan de forma predecible al incrementar el factor de dilución. Utilizando datos retrospectivos del Laboratorio de Diagnóstico Veterinario de la Universidad Estatal de Iowa (ISU VDL), se construyó una distribución empírica de 10.000 valores de Ct. El resultado es una herramienta práctica: se identificó el factor de dilución mínimo en el que el 95% de las muestras superan el umbral de 37, lo que indicaría un fallo en la detección del ARN del PRRSV. Esto sugiere que, si bien el pooling (mezcla de muestras) puede ahorrar costos, existe un límite técnico que, de superarse, dejaría "ciego" al sistema de vigilancia.

Finalmente, la investigación conecta la detección de estos patógenos con el impacto real en el bolsillo: la mortalidad. Utilizando modelos de regresión de Poisson, se analizó la asociación entre la detección semanal de virus y los recuentos de mortalidad en las granjas, ajustando los datos según el inventario de cerdos. Esta visión integral permite entender que el monitoreo no es un gasto, sino una herramienta de predicción sanitaria. La capacidad de detectar el virus en fluidos de lengua de animales muertos ofrece una ventana de oportunidad para ajustar las estrategias de bioseguridad antes de que el brote se extienda a toda la población.