Los ganaderos vanguardistas están con la Selección genómica

Buenas noches, mi nombre es Sandra Nuñez, MC. especialidad Mejoramiento Genético en bovinos. Esta técnica se conoce desde el año 2001, donde Meuwisser, Hayes y Goddar proponen la evaluación genómica. La selección genómica no es más que la técnica MAS (selección asistida por marcadores) pero a gran escala, con la ventaja de que no se necesita detectar QTLs previamente. A dichos marcadores les llamamos SNPs (polimorfismos nucleotíticos sencillos) que como mencionan en el artículo son esas partículas que reconocen el ADN. En el bovino se conocen de 50.000. Solo que para genotipar dichos SNPs se necesitan de chips que se comercializan por grandes casas genéticas que los fabrican. Para la evaluación genómica se necesitan de dos poblaciones; la primera se le llama de referencia en donde se estiman los efectos de los marcadores en individuos genotipados y medidos (genotipos y fenotipos), o la otra población se le denomina evaluada en ésta se utilizan las estimas de la primera pobalción para poder predecir el valor mejorante del segundo grupo en donde solo se requieren que los individuos estén genotipados. Estimando así los efectos de cada SNP sobre el carácter(es) de interés. La presición de dichas estimaciones dependen de 1. proporción de la varianza del QTL explicada por el SNP, 2. el desequilibrio de ligamiento que exista entre el SNP y QTL y 3. la distancia que existe entre ellos. Y resulta una técnica muy precisa ya que con caracteristicas cuyas h2 son medias (0.5) la precisión es de 0.85. Después del pequeño breviario cultural, me gustaría opinar que los grandes avances realizados en genómica nos proporcionan ahora nuevas herramientas para medir y mantener la diversidad y para utilizar de forma más eficiente, la variación genética aplicable en programas de selección y de conservación, pero en países primer mundistas y desarrollados en donde SI LLEVAN REGISTROS REPRODUCTIVOS, PRODUCTIVOS y CONTABLES, aparte de que tienen BIEN ESTABLECIDOS SUS OBJETIVOS DE PRODUCCIÓN. En los países tercer mundistas y me centro más a mi país (México) la mayoria del sector ganadero aún llevan muy empiricamente el manejo que se le debe de realizar al ganado, no se tienen objetivos de producción y sobre todo no se tiene un visión a futuro de esa empresa. Menos pidamos que cuenten con dichos registros y genealogias, que es lo que se necesita para llevar acabo programas de mejoramiento genético EFICIENTES, junto con la ayuda de las técnicas de IA y TE. Resumiendo, las casas de mejora genética, se deberian no solo de preocupar por vender el germoplasma, sino también en capacitar a sus compradores para que realicen registros y genealogias en su explotación, así realmente el productor tendrá un avance genético en su empresa. Y al asesorar al productor que se centren más en la explicación de los PTA´s ó HTP´s ó EBV´s en el caso del ganado de carne, las características físicas quedan en último término, a menos que se trate de un pie de cría y que su objetivo sea corregir alguna característica(s) física(s) en particular. Porque son muy pocos los estados que llevan algún programas de mejora genética probablemente eficiente, ya que tanta falta hace tener en este país y sus estados por los llamadas IGA que se ve también reflejado en el semen que se utiliza de otros países y se aplica en ganado mexicano, ese es otro tema del cual si estan interesados podriamos conversar posteriormente.

uN ARTÍCULO BASTANTE INTERESANTE, PERO COMO LO COMENTA MC SANDRA, CONSIDERO QUE HAY QUE PONER LOS OJOS EN PRODUCTORES DE TRASPATIO, A PEQUEÑA Y MEDIANA ESCALA, QUIENES POSIBLEMENTE TIENEN OTRAS NECESIDADES MAS APREMIANTES PARA SU PRODUCCION, QUIENES NO LLEVAN UN REGISTRO ADECUADO, TAN SOLO DE PRODUCCION DIARIA DE LECHE. CONSIDERO QUE EL MAYOR DE LOS RETOS ESTA EN LAS PEQUEÑAS EXPLOTACIONES, PARA HACERLAS MAS EFICIENTES EN SU PRODUCCION, CON LA INSEMINACION DE SUS HEMBRAS CON SEMENTALES DE ALTO VALOR PRODUCTIVO. PERO AUN ASI BUEN TRABAJO

FELICITACIONES POR EL ARTICULO ES MUY NUTRITIBO Y VA HA PERMITIR MEJORAR CON MAYOR RAPIDEZ EL GANADO VACUNO, ME GUSTARIA SABER EL COSTO DE TODA ESTA TECNOLOGIA PARA EL MEDIANO Y PEQUEÑO PRODUCTOR , QUE VA SER EL MERCADO PARA TRATAR DE MEJORAR LA PRODUCCIÓN.

Estimados foristas: Es cierto que el avance en genómica es inminente, y por suerte el futuro de la selección es muy promisorio gracias a esta herramienta, pero también es necesario marcar, como lo hizo la genetista Sandra Nuñez, quien describió perfectamente, como funcionan las tecnologias de SAM, y cuales son las poblaciones necesarias para validar estos test, que los kits hoy disponibles en el mercado, ademas de ser comercializados por empresas de genética, identifican solo una porción de los 50000 SNPs que se han logrado identificar. Ademas las poblaciones de referencia y evaluadas, deben hacerse en cada uno de los países donde los kits comerciales se aplican, hecho que no se lleva a cabo en todos ellos. Por este motivo hoy es una técnica complementaria, que en algunos lugares, como mi país Argentina, tiene casi carácter de anecdotico, sin embargo, hay resultados de distintos trabajos, que hemos podido llevar adelante, en los cuales se encuentran diferencias importantes entre individuos de una misma población, en las características que estos kits comerciales miden. Para no aburrirlos, estimados foristas, debemos ser cautos a la hora de elegir individuos por selección genómica hoy día,. Para que su impacto sea significativo, estas pruebas deben estar incorporadas a una prueba de progenie seria,enmarcada en el programa de evaluación de una raza, y con proyección nacional y los SNPs debidamente caracterizados en sus poblaciones de referencia, sino los valores de estos datos no aportarían mucho mas que un dato fenotípico, sin su debido ajuste, lo cual es mejor que nada, pero no alcanza para orientar un programa de selección genética. Saludos

buenas tardes amigos foristas. en el fascinante mundo de la reproducción bovina las nuevas tecnologías han ido apareciendo, con mayor o menor grado de efectividad en base a los resultados obtenidos, en los diferentes ambientes en los cuales se han puesto en practica. hoy estamos en presencia de esta nueva tecnología, con una gran influencia europea por el rico banco genético con el que cuentan y como podemos ver organizados en forma cooperativa convirtiéndose no solo en pioneros sino también en lideres mundiales. en Suramérica,particularmente en Venezuela no conocemos mucho al respecto,pero convencido de que si copiamos las buenas cosas, llámese nuevas tecnologías, podríamos obtener resultados mejores la invitación es que busquemos aplicar esta practica, sobre todo en nuestra raza carora y de seguro resultados muy buenos se pueden obtener.

exelente articulo, es la manera de lograr la mejor genetica en el hato por la gran disponibilidad de toros o semen genomicos. pero en vacas se realiza este programa

Cuando salió el artículo destacando la importancia de la selección genómica sentimos una alegría inconmensurable, debido a que el Consejo Nacional de Investigaciones Agropecuarias (CONIAF) dónde laboro aprobo un nuevo componente al proyecto "Mejoramiento genético del ganado criollo lechero"; el cual, tiene como propósito caracterizar el patrimonio genético de éste. Es evidente, que la caracterización genética permitirá en el futuro identificar los genes favorables del ganado criollo lechero y por ende identificar cuales toros lo poseen para agilizar el proceso de selección asistida por marcadores moleculares y obtener más producción de lechce con ejemplares perfectamente adaptados al trópico y sin necesidad de utilizar concentrados cuya materia prima es mayormente impotada con divisa foránea (dólares) Atentamente, Gabriel Domínguez Santo Domingo, R.D.

Estimados foristas, estoy trabajando en el tema de la seleccion asistida por marcadores geneticos desde el a ño 2008. Manejo un rodeo de 1800 bovinos Hereford y Polled Hereford iniciado por mi abuelo en 1940. Es un ciclo completo que vende novillos de 500 kgs y toros de 3 años para reproducción. La genética se incorpora por inseminacion artificial y se elige el semen por los datos de igenity. Nuestros toros tambié los elegimos por datos de igenity. Hemos notado un avance genético mayor y mas sólido desde que usamos esta herramienta, creo firmemente que es una gran ayuda para los ganaderos, totalmente objetiva, y que permite evaluar características como la eficiencia de conversion de forraje, que son importantisimas y muy dificiles de evaluar de otra manera.

Que realidad Colombia de muchos pero propiedad de pocos que ahogan a la mayoria de los ganaderos entods las ramas, cria, leche y carne. Que haremos. tengo una genetica en canada y quiero traerla pero debido a las condiciones economicas del mercado nadie se le mide.

MC. Sandra Nuñez escribe: como menciona un forista en particular, se deben de elaborar los chips en cada población (país y estado ó provincia), ya que cada chip es específico a la raza, población y en consecuencia al medio ambiente en donde se encuentre esa población. En mi comentario pasado mencioné que existen fuertes interacciones genotipo por ambiente (IGA) causando que la respuesta genética a través de germoplasma de toros seleccionados no va a ser la misma entre países, un ejemplo son las IGA existentes entre EUA-México, Canadá-México (Montaldo et al., 2009). Lo mismo pasa con el uso de sementales genómicos. Mi comentario va orientado a que en cada país se deben de eficientar los programas de mejoramiento genético, creando nuestras propias poblaciones para que el progreso genético sea mayor, para esto, debemos de tener muy bien establecidos y diferenciados los objetivos económicos de los fenotípicos, que no siempre son los mismos, así como tener en cuenta que ,por ejemplo, de una población de 100,000 vacas solo el 20% son elegidas para probarlas de las cuales solamente menos de un 5% son seleccionadas como el núcleo. Varios países en vías de desarrollo seguiremos importando germoplasma ya que esos núcleos se tienen en los países desarrollados, pero ya teniendo la introducción de ese germoplasma se pueden generar programas de mejora genética basándose en sistemas de cruzamientos eficientes creando poblaciones adaptadas a la región, aparte de aprovechar el gran pool de variabilidad genética presentan las poblaciones criollas así como participar en la conservación de las mismas. Un saludo.

MC. Sandra Nuñez escribe: como menciona un forista en particular, se deben de elaborar los chips en cada población (país y estado ó provincia), ya que cada chip es específico a la raza, población y en consecuencia al medio ambiente en donde se encuentre esa población. En mi comentario pasado mencioné que existen fuertes interacciones genotipo por ambiente (IGA) causando que la respuesta genética a través de germoplasma de toros seleccionados no va a ser la misma entre países, un ejemplo son las IGA existentes entre EUA-México, Canadá-México (Montaldo et al., 2009). Lo mismo pasa con el uso de sementales genómicos. Mi comentario va orientado a que en cada país se deben de eficientar los programas de mejoramiento genético, creando nuestras propias poblaciones para que el progreso genético sea mayor, para esto, debemos de tener muy bien establecidos y diferenciados los objetivos económicos de los fenotípicos, que no siempre son los mismos, así como tener en cuenta que ,por ejemplo, de una población de 100,000 vacas solo el 20% son elegidas para probarlas de las cuales solamente menos de un 5% son seleccionadas como el núcleo. Varios países en vías de desarrollo seguiremos importando germoplasma ya que esos núcleos se tienen en los países desarrollados, pero ya teniendo la introducción de ese germoplasma se pueden generar programas de mejora genética basándose en sistemas de cruzamientos eficientes creando poblaciones adaptadas a la región, aparte de aprovechar el gran pool de variabilidad genética presentan las poblaciones criollas así como participar en la conservación de las mismas.

Doctora SAndra Nuñez, muy interesante su posicion tecnica. Seria posible contactarle por fuera del foro?. Javier Betancourt

Dr Gabriel Dominguez, podriamos interactuar fuera del foro. Poseo una genetica Holstein que podria interesarles. JBR

Buenas tardes estimados foristas, tocando el tema de la "Exactitud", y apoyado en la opinión del Dr. Bennet Cassell, profesor emérito del Tecnológico de Virgina, en Blacksburg e Investigador en genética y manejo. Cuando la fuente de la predicción genética se basa en el promedio de los progenitores (Prueba de Pedigrí) para la predicción de producción de leche, ésta tendrá una confiabilidad de alrededor del 42% en el mejor de los casos. Hoy en día y ésto debe ser claro, la prueba con el chip 3K mejora esa exactitud a 60% si la imputación se basa en secuencias genómicas del toro progenitor y del abuelo materno, pero se elimina mucho de la especulación sobre los genes que ha heredado un individuo de sus progenitores. La exactitud del promedio de los progenitores se ve limitada porque no revela nada sobre la segregación mendeliana en cada individuo. La prueba 3K provee información muy útil sobre segregación mendeliana, pero un 60% de confiabilidad no nos pone en la categoría de "punto seguro". La prueba con el chip de 50K en la madre de un animal aumenta la confiabilidad de la prueba con el chip de 3K de 60 a 65%, mientras que la prueba con el chip de 50K en el animal mismo (sin hacer imputación alguna) produce alrededor del 72% de confianza. El chip de 800K aumenta poco la exactitud de la predicción de producción de leche en comparación con el chip de 50K. Sin embargo, también se sabe que hay otras características en donde el mejoramiento es más impresionante, seguimos aprendiendo sobre ello. Por el momento, de acuerdo a las Asociaciones de razas, estas pruebas están disponibles para hembras pero no para machos. Las pruebas genómicas en machos son realizadas sólo bajo el patrocinio de las organizaciones que invirtieron en la investigación original. Esta restricción expira a principios del 2013. Dos datos importantes, mientras las Asociación Americana de Holstein alienta a no miembros a participar en las pruebas con el chip de 3K, pero sí exige la identificación básica de los animales probados como parte de su esfuerzo, la Asociación Americana Jersey hará la prueba sólo en animales de registro, habiendo ciertas condiciones para poder calificar a lo que se llama "registro" que durante años han estado promoviendo en el mejoramiento de la raza. Recuerde, las secuencias genómicas en ancestros cercanos (Padres y abuelos maternos) son necesarias para que se puedan llenar los grandes huecos de la prueba con el chip de 3K por medio de imputaciones. Aquellos productores que deseen ensayar con la prueba 3K deben usarla en vaquillas o vacas que sean progenie de toros de Inseminación Artificial y de vacas que también hayan sido progenie de toros de I.A.

Dr. Ortíz: con mucho interés he leido su exposición, lo que me ha traido las siguientes dudas: 1.- ¿ en que porcentaje considera ud. que las cooperativas y compañias de inseminación estén usando ya ese sistema? ( el de los marcadores para seleccionar sementales con alta confiabilidad? 2.- ¿ cuales serían los márgenes de error en la obtención de dichos datos? '

De las ciencias con la mayor variabilidad esta la genética, ya que sabemos la extensión de este OCEANO pero desconocemos su profundidad y la mayoría de lo que esconde. Si fuera tan fácil en genética decir que uno más uno es dos, todos los ganaderos del mundo tendríamos vacas elite o perfectas genéticamente, ya que se usan toros probados pero por más perfecta que sea la vaca y el toro no me garantizan el resultado, solo me reducen los errores. Me fascina el tema pero nuestra generación no verá tan fácil sus resultados. Cada tiempo en tiempo aparecen más y más datos que alteran todas estas hipótesis o nos muestran el desconocimiento genético que tenemos sobre las especies que explotamos económicamente y me sorprendo con los descubrimientos que día a día aparecen. Espero estos nuevos toros se muestren con la realidad que tienen y pueden dar y no sea otro método de venta en un mercado que lentamente está más presionado por resultados. El riesgo de cometer un error y pagarlo en corto tiempo también está palpable.

De acuerdo con varios de los foristas, en particular la Dra. Sandra y el Dr. Nacho, quiero complementar insistiendo en que más que crear "nuevos chips", (porque es probable que hayan variantes genéticas diferentes en los mismos genes entre razas, sobre todo las criollas) es necesario "validar" estas pruebas genómicas con poblaciones de referencia locales mediante la comparación de los genotipos de los ejemplares locales con medidas de las características fenotípicas (registradas rigurosamente) que se quieran validar. Ya que, por ejemplo, si se utiliza una prueba validada en una población de la raza X en USA generalmente no tiene el mismo efecto en otra población de esa misma raza X en otro país, bajo otro ambiente, otro manejo, otras enfermedades etc.. Ejemplo de esto son investigaciones como la de Van Eenennaam et al 2007 y Johnston & Graser 2010, en particular en esta última en Australia en una población cercana a 12.300 animales (donde habían ejemplares de razas ya probadas en USA) al evaluar las pruebas de la marca GeneStar no encontraron asociación con la mayoría de características fenotípicas evaluadas. Esto muestra al tarea ardua que tenemos los profesionales del área para desarrollar, ajustar y validar pruebas genómicas en poblaciones locales, primero, mediante programas de registro exhaustivo de las características a evaluar (que dependen de los objetivos trazados) y de la evaluación posterior de los efectos de las variantes genéticas identificadas en la población de referencia, con el fin de brindar herramientas confiables a los productores y criadores de nuestros países.

La USDA mediante la AIPL publican con cada Prueba las comparaciones entre las evaluaciones genómicas y las tradicionales (una vez que nacen las hijas de éstos toros y entran al control de producción) de los toros de Inseminación Artificial activos o extranjeros. En ésta ocasión participaron 521 toros Holstein Activos para las pruebas de Abril 2011. Rasgo Prom. genom. Prom trad. Diferencia Conf. Prom Genom. Conf. Prom. trad. Diferencia ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- MNV$ 247 248 -2 87% 81% +6 Leche (Lbs) 550 563 -14 93% 91% +2 Grasa (Lbs) 26.2 26.6 -0.4 93% 91% +2 Prot. (Lbs) 18.6 19.0 -0.4 93% 91% +2 Vida Prd.(mes) 1.5 1.6 +0 81% 71% +9 CCS 2.89 2.89 +0 88% 83% +5 TPH (%) -0.2 -0.2 +0 79% 69% +10 Score final 1.22 1.18 +0.04 89% 85% +4 Fac.par.toro(%) 7.5 7.6 +0 90% 84% +6 Fac.par.hija(%) 7.8 7.8 +0 80% 67% +13 Los Centros de Inseminación Artificial serios están utilizando hoy en día los análisis genómico para determinar más eficientemente los becerros más prometedores y con mayor confiabilidad para el avance genético de los hatos en el mundo. Recuerde que mientras la prueba tradicional de un toro tarda 5-6 años, con la prueba genómica sólo se requieren de 3 años, por lo tanto el avance generacional es mayor

primero hay que explicarles que es GENOMICA, luego en que consiste la SELECCIÓN GENÓMICA y luego pedirles su opinión.

DISEÑO GENÉTICO Y SELECCIÓN GENÓMICA Para diseñar Genética con éxito. Es de trascendental importancia, haber conocido en cuerpo cierto,el historial genético que arrastra el animal a tiempo presente . Para evaluar, mejorar y proyectar de manera mas real y satisfactoria su evolución. CONSIDERANDO la información genómica generacional, necesaria para agregar atributos de carácter Bio -Económicos a la siguiente generación, en una ganadería de precisión .